吸纳政府职能部门、行政事业单位、旅游院校、行业协会、行业企业和科研机构等单位组建协同创新中心，形成三层运行结构：一是协同牵头单位，由重庆师范大学、重庆市文化和旅游发展委员会2家组成；二是核心协同单位，由重庆市旅游信息中心（文化和旅游部数据中心重庆分中心）、国家地球系统科学数据共享平台、重庆八戒工程网络有限公司、重庆日报报业集团、北京中科博道旅游规划院、重庆工商大学、重庆城市管理学院、重庆市旅游学校等8家组成；三是参与协同单位，由忠县人民政府、彭水自治县人民政府、城口县人民政府、重庆市旅游协会、Next architects（中国荷兰建筑事务所）、涪陵区武陵山旅游区管委会、中智游科技有限公司、北京天一景观规划设计院、布洛斯酒店投资管理（昆山）股份有限公司、金科酒店管理集团等10家组成。